Откуда такая ненависть к начальнику института? По материалам Главной военной прокуратуры в деле фигурируют один офицер из 13 ГНИИ и один офицер заказывающего Управления ВВС.
Источник: http://gvp.gov.ru/news/view/285/

Почему застрелился начальник 2 управления вообще тёмная история.

По поводу перевода ЭРАТ в Воронеж никакой информации нет даже на уровне слухов.