Еще могло бы помочь понимание, почему пропущен тип "9".
Это вещи не связанные, никто не обещал, что номера типов должны идти подряд, без пропусков, обычно их присваивают "как удобнее", 10 пришла с Омска. Пе-3 и опытные Пе-3бис имели номер 39 - серия - номер.

Это с 39 завода самолет? И есть какие-нибудь документы, которые подтверждают эту расшифровку?
По Пе-3Бис завода №39 известно мало, выпущено всего 135 машин. Возможно сокращ. запись номера или очередная перетурбация.

Тогда это было часто, пример Омск:

Ту-2 (1942)10-серия-номер, Як-9(1943) серия-166-номер, Ту-2С(1946) 166-серия номер, Ил-28(1950) - серия-166-номер, итд.