В 1958 г, выпуск Ту-16 временно прекратился, т.к. завод освоил производство Ту-104Б, а в следующем году стал переходить к сверхзвуковому Ту-22. В 1961 г. в Казани восстановили выпуск Ту-16, но уже в варианте ракетоносца Ту-16К-10 для Авиации ВМФ. Последние Ту-16К-10 были выпущены в декабре 1963 г. С 1961 года по 1963 год завод №22 выпустил 30 серий по 5 самолетов Ту-16К-10. У этих самолетов была необычная система обозначения: первая цифра – ничего не значила, вторая и третья – номер серии, четвертая – год выпуска, пятая и шестая – номер самолета в серии, седьмая цифра ничего не значила. Так Ту-16К-10 №4652012 расшифровывается как первый самолет 65 серии 1962 года выпуска. Всего было построено 800 машин следующих модификаций: бомбардировщик Ту-16, носитель ядерного оружия Ту-16А, ракетоносец Ту-16КС, постановщик помех Ту-16Е и ракетоносец Ту-16К-10.