Пилоты, летающие на различных модификациях F/A–18, жалуются на проблемы с дыханием. Пилоты жалуются на удушье, головокружение, наличие посторонних раздражающих запахов и потерю ориентации. При этом количество жалоб на приступы удушья резко выросло — если в 2006 году фиксировалось 3,66 случая на 100 000 летных часов для F/A–18D, 2,18 для F/A–18E–F и 0 для F/A–18G, то в период с 31 октября 2013 по 1 ноября 2014 года частота возникновения проблем с дыханием подскочила до 29,54, 26,39 и 15,05 на сто тысяч летных часов соответственно.
Масштабы проблемы показались командованию достаточно большими, чтобы организовать расследование причин этих жалоб. Так, было определено, что в 93 случаях наблюдалось загрязнение воздуха в кабине, в 90 случаях отмечались отказы систем жизнеобеспечения, естественно, не обошлось без человеческого фактора — 67 случаев, зафиксирован 41 случай проблем с кислородной системой, 11 отказов системы подачи дыхательной смеси, еще в 45 случаях причина не была определена. Зачастую инциденты возникали из–за нескольких из перечисленных выше причин.
К настоящему времени в системы жизнеобеспечения "Хорнетов" внесено уже 18 изменений, подобно тем, что были внедрены на F–22 несколько лет тому назад, однако ощутимого результата это не принесло. Истинные причины проблем пока не выяснены.