Как-то так это объясняют:
"Переносить столь длительные полеты экипажу В-2А, состоящему всего из двух человек, помогает высокий уровень автоматизации, хорошо продуманная эргономика кабины, а также специальное оборудование, включающее такие "маленькие радости", как химический туалет, спинки катапультных кресел с вибромассажерами и меню бортпайка, составленное с учетом вкусов конкретного летчика."
Учитывая что по открытым данным оба места пилотов полностью дублированы органами управления, предположу что отдыхают по-очереди, тем-более что никаких активных действий от них в большую часть времени не требуется. Но все-равно - предположительно 3-4 дозаправки в воздухе и 30-35 часов в полете должны напрягать ... Очевидно крепкие ребята + передовая фармакология в штатах им в помощь (судя по их спортсменам).